一、流体动力效应：譬如最新的铒铬YSGG激光，主要为激光激发水分子产生高速动力的流体力学。水分子极易吸收此一波长的激光能量，却不至于破坏水分子的键结结构。若其激光能量撞击到水分子，则可使水分子激发成为具有高速动能的状态，此一流体动能便能达到组织切割的良好效果，即是采用水分子作为组织切割之媒介。

二、机械效应：激光切割硬组织的能力不是来自温度效应，而是藉由能量将组织中的水蒸发，造成组织内压力增高，在硬组织熔点未到达之前就造成组织的破裂(rupture)，这个现象特称之为微爆发，和温度效应无直接相关。

三、温度效应：软组织之切割主要以此效应来达成。组织吸收激光能量后温度会升高，当温度在370C至600C时组织不会产生变化，一旦超过600C时即开始凝固，可达到止血的效果，当温度超过1000C，细胞间的水分会被蒸发，剩下脱水的组织超过2000C以上时会被碳化。